در خاک، کلسیم در ارتباط با منیزیم و سدیم بررسی می شود و فاکتور نسبت جذب سدیم (SAR) و همچنین نسبت کلسیم به منیزیم ( Ca/Mg) مشخص کننده وضعیت این عنصر در خاک می باشد. به طور کلی نسبت جذب سدیم (SAR) کمتر از ۱۵ و نسبت کلسیم به منیزیم (Ca/Mg) بیشتر از یک در محلول خاک نشان دهنده وضعیت نسبتاً مناسب کلسیم در خاک می باشد. در گیاهان مبتلا به کمبود کلسیم برگهای جوان و نزدیک انتهای شاخه به شکل چروکیده و کج درآمده و نوک برگ ها و حاشیه آنها به طرف بالا و یا پائین لوله میشود. کمبود کلسیم باعث عارضه اضمحلال پوست استخوانی یا لکه پوست استخوانی در اوائل اردیبهشت در مرحله ارزنوشدن و هنگام توسعه میوه میگردد.
علائم کمبود کلسیم روی برگ درختان پسته 
عارضه اضمحلال پوست استخوانی میوه پسته در اثر کمبود کلسیم
